準備階段：申辦者負責選擇、確定醫療器械臨床試驗的協調研究者，明確各參與臨床試驗的機構及主要研究者。申辦者分別向各中心提供相同的臨床試驗方案，并經過倫理審查。倫理審查通過后，各中心開始準備試驗所需的設備、人員等。

進行階段：各中心按照同一臨床試驗方案實施臨床試驗，使用相同的病例報告表和填寫指導說明，以記錄在醫療器械臨床試驗中獲得的試驗數據。申辦者應確保各中心主要研究者之間的溝通，協調研究者承擔多中心臨床試驗中各中心的協調工作。

完成階段：各中心臨床試驗小結應當由該中心的主要研究者簽名、注明日期，經該中心的醫療器械臨床試驗機構審核簽章后交申辦者。多中心臨床試驗報告應當由協調研究者簽名、注明日期，經組長單位醫療器械臨床試驗機構審核簽章后交申辦者。

各中心審批流程和要求各不相同，導致多中心臨床試驗立項、倫理審查及協議簽訂等過程耗時較長。

各中心水平具有差異性，倫理委員會審查質量參差不齊，影響臨床試驗的啟動速度。

不同中心所在區域經濟發展水平及文化背景也存在差異，當地倫理委員會也會代表本地受試者權益進行審查。

臨床試驗中產生的數據應嚴格按照實驗操作規程進行數據記錄存檔，確保數據的完整性和可追溯性。

原始數據應認真保留，不得涂改、丟失。對記錄的實驗數據應歸類和編號保存，并嚴格保管、預防丟失。

申辦者應承擔醫療器械臨床試驗的監查責任，督促各中心遵循醫療器械臨床試驗質量管理規范要求開展臨床試驗。

為保證多中心臨床試驗的質量，各中心在知情同意書簽署、受試者入選、方案執行、數據記錄、安全性信息處理與報告、試驗器械管理等過程操作應盡可能統一。

臨床試驗數據是醫學重要資料，應長期保存，并確保數據的安全性。

涉及個人隱私的資料，如臨床標本試驗數據及健康體檢實驗數據，應嚴格保密，不得公開。