醫療器械生產企業確保支氣管CT影像處理軟件的用戶隱私保護，可以采取以下措施：

1. 收集用戶信息時的隱私保護：

2. 在收集用戶信息時，應明確告知用戶信息的收集目的、使用方式和范圍，并獲得用戶的明確同意[1]。

3. 只收集必要的信息，避免過度收集用戶的個人數據[1]。

4. 加強數據加密與安全存儲：

5. 使用高強度的加密算法對用戶數據進行加密，確保數據在傳輸和存儲過程中的安全性[1]。

6. 對存儲的用戶數據進行定期備份，以防止數據丟失，并確保備份數據的安全性[1]。

7. 嚴格管理用戶數據訪問權限：

8. 限制員工和第三方對用戶數據的訪問權限，確保只有授權人員才能訪問用戶數據[1]。

9. 定期進行權限審查，及時撤銷不再需要的訪問權限[1]。

10. 合規使用用戶數據：

11. 僅在用戶同意的范圍內使用用戶數據，不得將數據用于其他未經用戶同意的目的[1]。

12. 避免將用戶數據泄露給第三方，除非得到用戶的明確授權或法律要求[1]。

13. 建立隱私政策和數據保護制度：

14. 制定詳細的隱私政策，明確說明企業如何收集、使用和保護用戶數據，以及用戶在隱私保護方面的權利和責任[1]。

15. 定期對隱私政策和數據保護制度進行審查和更新，以確保其符合法律法規的要求和用戶的期望[1]。

16. 加強員工培訓和意識提升：

17. 對員工進行隱私保護和數據安全的培訓，提高員工對隱私保護重要性的認識[2]。

18. 培養員工的安全意識，確保他們在處理用戶數據時始終遵循企業的隱私政策和數據保護制度[2]。

19. 及時響應和處理隱私泄露事件：

20. 建立應急響應機制，確保在發生隱私泄露事件時能夠迅速采取措施，減少損失[2]。

21. 對用戶報告的隱私問題進行及時回應和處理，增強用戶對企業的信任度[2]。

通過以上措施，醫療器械生產企業可以更有效地確保支氣管CT影像處理軟件的用戶隱私保護，提升用戶信任度和企業形象。同時，企業也需要密切關注相關法律法規的變化，及時調整和完善隱私保護措施，以確保合規經營和用戶權益的保障。